S1线全长10.210千米，共设车站8座，车辆段1座。工程西起门头沟新城西南角的石门营站，向东跨越京原路（规划三石路），经棚户改造区预留的交通走廊，跨越既有莲石路至规划沙石坑西侧路路北敷设，之后转向北沿规划滨河路南延路中敷设，至石龙路转向东，平行于石龙路沿路南侧敷设，分别跨越西六环、永定河、铁路丰沙线后，穿越石景山至既有京门铁路线，而后线路向东沿京门铁路南侧控制带敷设，至苹果园交通枢纽，并与既有M1线、M6线形成换乘。